PPGCS/CCBS

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: PEDRO FELIPE RODRIGUES SOUSA
DATA: 18/01/2021
HORA: 09:00
LOCAL: Defesa on-line
TÍTULO: PROSPECÇÃO GENÔMICA DE METABÓLITOS BIOATIVOS PROVENIENTES DE MICROALGAS EXTREMÓFILAS:APLICAÇÕES NA ÁREA DA SAÚDE
PALAVRAS-CHAVES: Mineração Genômica; Fitoplâncton; Chlamydomonas; Jaagichlorella;Bioprospecção; Bioinformática
PÁGINAS: 67
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Biologia Geral
RESUMO: Microalgas são microrganismos eucariotos capazes de utilizar em seu metabolismo vias autotróficas e heterotróficas. Podem ser encontradas nos mais diversos tipos de ambientes aquáticos. Determinados tipos de ambientes possuem condições extremas as quais organismos se adaptam para poder sobreviver. Essas adaptações induzem especializações e ativação de vias metabólicas secundárias capazes de produzir compostos que permitem a sobrevivência de organismos nas mais variadas condições. Diversos destes metabólitos secundários possuem atividades contra microrganismos devido a competição do meio, antibiofilme, atividade antioxidante, protetiva e dentre outras. A bioprospecção visa buscar produtos naturais com diversas atividades biológicas que possam ter aplicabilidade biotecnológica e impacto na sociedade. Deste modo, este trabalho buscou avaliar o potencial biotecnológico em saúde, usando técnicas in silico de prospecção, de 2 microalgas verdes Chlamydomonas acidophila e Jaagichlorella hainangensis. Ambas as microalgas foram isoladas de ambientes extremófilos: Chlamydomonas acidophila de uma Drenagem Ácida de Mina de Cobre e Jaagichlorella hainangensis de um lago natural de Ferro também em zona de mineração. Após as etapas de obtenção dos genomas, controle de qualidade e montagem dos mesmos foi realizada a anotação destes utilizando a plataforma GenSAS. Para predição de agrupamentos gênicos ligados a metabólitos secundários foi utilizada a plataforma antiSMASH nas versões bactéria e fungo. O antiSMASH apontou diversos clusters gênicos ligados a vias biossintéticas de metabólitos secundários de interesse em ambas as microalgas tais como, terpenos, sideróforos e ectoínas. O resultado destes clusters preditos foram analisados através de gráficos de sintenia com os agrupamentos depositados no MIBiG e as possíveis funções dos genes foram preditas através de BLAST no CDD e no banco de dados PFAM. O antiSMASH também apontou clusters classificados como peptídeos síntase não-ribossômicos (NRPS) e policetídeo sintases (PKS) no genoma das 2 microalgas e clusters híbridos NRPS/PKS somente em Jaagiclhorella hainangensis. Os genes relacionados a PKS tipo I foram os de maior prevalência em Jaagichlorella hainangensis, seguidos dos genes relacionados ao tipo III. No entanto, este perfil não é encontrado em Chlamydomonas acidophila na qual somente os genes relacionados a PKS tipo III foram identificados. Análises mais robustas com os clusters NRPS e PKS preditos nos genomas destas microalgas foram realizadas utilizando a plataforma NaPDoS. Somente em Jaagichlorella hainangensis 2 clusters foram vinculados com baixa similaridade a vias biossintéticas, sendo um destes um agrupamento PKS similar a sequência de um metabólito já conhecido com atividade anticâncer. A falta de resultados em Chlamydomonas acidophila e nos clusters remanescentes em Jaagichlorella hainangensis apontam que estas sequencias podem estar relacionadas com vias não categorizadas ou não inseridas no NapDoS e nestes casos estão ligadas a compostos de caráter inédito. Obter estes dados preliminares nestas espécies, direcionam possíveis experimentos in vitro os quais possam ser realizados com objetivo de extração de metabólitos secundários bem como elucidar vias metabólicas. Além de contribuir com bancos de dados genômicos com os agrupamentos gênicos preditos para possíveis relações sintenicas e expansão do conhecimento genômico de microalgas.
MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 2284981 - CLAUDIA QUINTINO DA ROCHA
Externo à Instituição - EVONNILDO COSTA GONÇALVES - UFPA
Presidente - 1523993 - HIVANA PATRICIA MELO BARBOSA DALL AGNOL
Interno - 1555889 - RAFAEL CARDOSO CARVALHO