Banca de QUALIFICAÇÃO: YURI RAMOS MENEZES SANTOS SOEIRO
2022-11-07 18:36:57.784
Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: YURI RAMOS MENEZES SANTOS SOEIRO
DATA: 09/11/2022
HORA: 14:00
LOCAL: Google Meet
TÍTULO: Aplicação de métodos de Dinâmica Molecular e QM/MM no estudo reacional de enzima lisina metiltransferase G9a
PALAVRAS-CHAVES: Epigenética, Histona 9, Dinâmica Molecular.
PÁGINAS: 51
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Química
RESUMO: A epigenética é a área de conhecimento responsável por examinar o comportamento dos genes e como eles reagem diante de inúmeros fatores que estão presentes ao logo da vida do indivíduo. Uma das maneiras de realizar esse tipo de estudo é por meio do método de dinâmica molecular (DM) o qual é muito utilizado em sistemas com características biológicas permitindo que os sistemas replicados computacionalmente se assemelhem a situação biológica real. Neste trabalho foi investigado os mecanismos de reação e atividade da enzima lisina metiltransferase (MT) G9a por meio de simulações de dinâmica molecular. Foram analisadas mutações que a histona 3 lisina 9 (H3K9) pode sofrer por conta dos mecanismos epigenéticos, e calculados os valores de energia livre referente a cada uma dessas mutações, também foi verificado o comportamento da H3K9 e suas mutações em complexo com a MT G9a e o comportamento reacional dos sistemas. Para o desenvolvimento do trabalho foram usadas estruturas obtidas do Protein Data Bank para utilização das estruturas utilizadas ao longo da pesquisa onde essas estruturas/sistemas foram tratadas com o campo de força CHARMM32 e simulados no software NAMD. 5 sistemas foram construídos: H3K9 nativo e mutantes: H3K9M, H3K9A, H3K9I e H3K9Nle. Foram realizadas diferentes analises com o intuito de verificar qual desses mutantes se destacaria quando em complexo com a enzima G9a e consequentemente a inibição do processo de metiltransferase relacionado ao processo de neoplasia. Os resultados dos primeiros 100ns de dinâmica molecular mostram que os mutantes H3K9M e H3K9I apresentaram complexos mais estáveis, cálculos de energia livre usando MM/PBSA e MM/GBSA apontaram novamente as mutações H3K9M e H3K9I como as mais energicamente favoráveis. Esses resultados estão de acordo com as observações experimentais disponíveis na literatura. Sendo assim a lisina 9 com a mutação da metionina e da isoleucina podem atuar como inibidores eficientes da enzima G9a, posteriormente podendo ocasionar problemas como o câncer.
MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - ALBERTO MONTEIRO DOS SANTOS - UNICAMP
Presidente - 2583455 - JALDYR DE JESUS GOMES VARELA JUNIOR
Interno - 3159075 - MARCO AURELIO SULLER GARCIA